Il parco è suddiviso in varie tenute, situate sia a sud che a nord della foce dell’Arno. A sud della foce dell’Arno si trovano la Tenuta di Tombolo,che include la riserva naturale Cornacchiaia-Ulivo, e laTenuta di Coltano che include la riserva naturale Bosco degli Allori. A nord della foce dell’Arno si trovano, invece, la Tenuta di San Rossore,cheinclude le riserve naturali del Paludetto, di Palazzetto, Lame di Fuori e Bosco di San Bartolomeo, la Tenuta di Migliarino, che include le riserve naturali di Bocca di Serchio, del Bozzone, del Fiumaccio, della Bufalina e dell’Ugnone, e il Padule Meridionale di Massaciuccoli. In provincia di Lucca sono ubicati, infine, il Padule Settentrionale, il Lago di Massaciuccoli, e le riserve naturali della Guidicciona e della Lecciona, facenti parte quest’ultime della Tenuta Borbonese e Macchia Lucchese.